Reproducible Bioinformatics with Python pdf

Ken Youens Clark trabaja como ingeniero de datos en The Critical Path Institute, donde ayuda a los socios de la industria, la academia y el gobierno a encontrar terapias farmacológicas novedosas para enfermedades que van desde el cáncer y la tuberculosis hasta miles de enfermedades raras. Su carrera en bioinformática comenzó en 2001 cuando se unió a un proyecto de genómica de plantas en el Laboratorio Cold Spring Harbor bajo la dirección del Dr. Lincoln Stein, un destacado autor de libros y módulos en Perl y uno de los primeros defensores del software abierto, los datos y la ciencia. En 2014, Ken se mudó a Tucson, AZ, para trabajar como programador científico sénior en la Universidad de Arizona, donde completó una maestría en ingeniería de biosistemas en 2019. Mientras estuvo en la UA, Ken disfrutó enseñando habilidades de programación y bioinformática, y utilizó algunas de esas ideas. en su primer libro, Tiny Python Projects (Manning, 2020), que utiliza un enfoque de desarrollo basado en pruebas para enseñar Python.

Reproducible Bioinformatics with Python pdf por Ken Youens Clark

Life scientists today urgently need training in bioinformatics skills. Too many bioinformatics programs are poorly written and barely maintained--usually by students and postdoc researchers who've never learned basic programming skills. This practical guide shows how to exploit the best parts of Python for solving problems in biology while also creating documented, tested, reproducible software.

Ken Youens-Clark, author of Tiny Python Projects (Manning), demonstrates how to write effective Python code and how to use tests to write and refactor scientific programs. You'll learn the latest Python features and tools--such as linters, formatters, type checkers, and tests--to write documented and tested programs.