Il professor Harari è nato ad Haifa, in Israele, da genitori libanesi nel 1976. Ha conseguito il dottorato di ricerca. dall'Università di Oxford nel 2002, ed è attualmente docente presso il Dipartimento di Storia, l'Università Ebraica di Gerusalemme.
Si è specializzato in Storia del mondo, storia medievale e storia militare. La sua attuale ricerca si concentra su questioni macrostoriche: qual è la relazione tra storia e biologia? Qual è la differenza essenziale tra l'Homo sapiens e gli altri animali? C'è giustizia nella storia? La storia ha una direzione? Le persone sono diventate più felici con lo svolgersi della storia?
Il Prof. Harari tiene anche un MOOC (Massive Open Online Course) intitolato A Brief History of Humankind.
Il Prof. Harari ha vinto due volte il Premio Polonsky per la creatività e l'originalità, nel 2009 e nel 2012. Nel 2011 ha vinto il Premio Moncado della Society for Military History per articoli eccezionali di storia militare.