Reproducible Bioinformatics with Python pdf

Ken Youens Clark lavora come ingegnere dei dati presso il Critical Path Institute, dove aiuta partner dell'industria, del mondo accademico e del governo a trovare nuove terapie farmacologiche per malattie che vanno dal cancro e dalla tubercolosi a migliaia di malattie rare. La sua carriera nel campo della bioinformatica è iniziata nel 2001 quando è entrato a far parte di un progetto di genomica vegetale presso il Cold Spring Harbor Laboratory sotto la direzione del Dr. Lincoln Stein, un importante autore di libri e moduli in Perl e uno dei primi sostenitori del software aperto, dei dati e della scienza. Nel 2014 Ken si è trasferito a Tucson, in Arizona, per lavorare come Programmatore Scientifico Senior presso l'Università dell'Arizona, dove ha completato un Master in Ingegneria dei Biosistemi nel 2019. Mentre era in UA, Ken si è divertito a insegnare competenze di programmazione e bioinformatica e ha utilizzato alcune di queste idee nel suo primo libro, Tiny Python Projects (Manning, 2020), che utilizza un approccio di sviluppo basato su test per insegnare Python.

Reproducible Bioinformatics with Python pdf da Ken Youens Clark

Life scientists today urgently need training in bioinformatics skills. Too many bioinformatics programs are poorly written and barely maintained--usually by students and postdoc researchers who've never learned basic programming skills. This practical guide shows how to exploit the best parts of Python for solving problems in biology while also creating documented, tested, reproducible software.

Ken Youens-Clark, author of Tiny Python Projects (Manning), demonstrates how to write effective Python code and how to use tests to write and refactor scientific programs. You'll learn the latest Python features and tools--such as linters, formatters, type checkers, and tests--to write documented and tested programs.