Reproducible Bioinformatics with Python pdf

Кен Юэнс Кларк работает инженером по обработке данных в Институте критического пути, где помогает партнерам в промышленности, академических кругах и правительстве находить новые лекарственные средства для лечения различных заболеваний, от рака и туберкулеза до тысяч редких заболеваний. Его карьера в области биоинформатики началась в 2001 году, когда он присоединился к проекту геномики растений в лаборатории Колд-Спринг-Харбор под руководством доктора Линкольна Штейна, известного автора книг и модулей на Perl и одного из первых сторонников открытого программного обеспечения, данных и науки. В 2014 году Кен переехал в Тусон, штат Аризона, чтобы работать старшим научным программистом в Университете Аризоны, где в 2019 году он получил степень магистра в области инженерии биосистем. Во время работы в UA Кену нравилось преподавать навыки программирования и биоинформатики, и он использовал некоторые из этих идей. в своей первой книге Tiny Python Projects (Manning, 2020), в которой для обучения Python используется подход к разработке через тестирование.

Reproducible Bioinformatics with Python pdf Кен Юенс Кларк

Life scientists today urgently need training in bioinformatics skills. Too many bioinformatics programs are poorly written and barely maintained--usually by students and postdoc researchers who've never learned basic programming skills. This practical guide shows how to exploit the best parts of Python for solving problems in biology while also creating documented, tested, reproducible software.

Ken Youens-Clark, author of Tiny Python Projects (Manning), demonstrates how to write effective Python code and how to use tests to write and refactor scientific programs. You'll learn the latest Python features and tools--such as linters, formatters, type checkers, and tests--to write documented and tested programs.