Profesör Harari, 1976'da İsrail'in Hayfa kentinde Lübnanlı bir ailenin çocuğu olarak dünyaya geldi. Doktora derecesini aldı. 2002 yılında Oxford Üniversitesi'nden mezun oldu ve şu anda Kudüs İbrani Üniversitesi Tarih Bölümü'nde öğretim görevlisi.
Dünya Tarihi, ortaçağ tarihi ve askeri tarih alanlarında uzmanlaştı. Şu anki araştırması makro-tarihsel sorulara odaklanıyor: Tarih ve biyoloji arasındaki ilişki nedir? Homo sapiens ile diğer hayvanlar arasındaki temel fark nedir? Tarihte adalet var mı? Tarihin bir yönü var mı? Tarih ilerledikçe insanlar daha mı mutlu oldu?
Prof. Harari ayrıca İnsanlığın Kısa Tarihi başlıklı bir MOOC (Kitlesel Açık Çevrimiçi Kurs) dersi vermektedir.
Prof. Harari, 2009 ve 2012'de Polonsky Yaratıcılık ve Orijinallik Ödülü'nü iki kez kazandı. 2011'de askeri tarihte seçkin makaleler için Askeri Tarih Derneği'nin Moncado Ödülü'nü kazandı.