Reproducible Bioinformatics with Python pdf

肯·尤恩斯·克拉克 在关键路径研究所担任数据工程师，他帮助工业界、学术界和政府的合作伙伴为从癌症和肺结核到数千种罕见疾病的疾病寻找新的药物疗法。 他的生物信息学职业生涯始于 2001 年，当时他加入冷泉港实验室的植物基因组学项目，在林肯斯坦博士的指导下，他是 Perl 书籍和模块的著名作者，也是开放软件、数据和科学的早期倡导者。 2014 年，Ken 搬到亚利桑那州图森市，在亚利桑那大学担任高级科学程序员，并于 2019 年完成了生物系统工程硕士学位。在 UA 期间，Ken 喜欢教授编程和生物信息学技能，并运用了其中的一些想法 在他的第一本书 Tiny Python Projects（Manning，2020 年）中，该书使用测试驱动的开发方法来教授 Python。

Reproducible Bioinformatics with Python pdf 肯·尤恩斯·克拉克

Life scientists today urgently need training in bioinformatics skills. Too many bioinformatics programs are poorly written and barely maintained--usually by students and postdoc researchers who've never learned basic programming skills. This practical guide shows how to exploit the best parts of Python for solving problems in biology while also creating documented, tested, reproducible software.

Ken Youens-Clark, author of Tiny Python Projects (Manning), demonstrates how to write effective Python code and how to use tests to write and refactor scientific programs. You'll learn the latest Python features and tools--such as linters, formatters, type checkers, and tests--to write documented and tested programs.